На 27 июля 2010 года при уровне верхнего бьефа 313,82 м в водохранилище сложился запас ёмкости для принятия паводка в объёме 2,78 км3 до достижения нормального подпорного уровня (НПУ), который фиксируется на отметке 315,0 м (Балтийская система высот).
Сработка Зейского водохранилища в объёмах 2000±150м3/с, произведенная на Зейской ГЭС с 29 мая по 24 июля 2010 года через водосливную часть плотины и гидроагрегаты, позволила значительно снизить уровень верхнего бьефа и создать резерв для аккумулирования сезонной летней приточности в водохранилище. В это время уровень Зейского водохранилища приводился к нормам, предусмотренным Правилами использования водных ресурсов (ПИВР). Так, уже 11 июля 2010 года разница между фактическим уровнем водохранилища и уровнем, предусмотренном ПИВР на 1 мая 2010 года, была уменьшена на 1,39 м.
В результате проливных дождей, прошедших в бассейне Зейского водохранилища во второй декаде июля 2010года, увеличился объем размыва грунта под городским водоводом, пролегающим близ русла реки Зеи, в нижнем бьефе гидроузла. По согласованию с Амурским бассейновым водным управлением (АБВУ) 24 июля 2010 года на Зейской ГЭС закрыта водосливная часть плотины и остановлены холостые сбросы воды.
По рекомендациям АБВУ до достижения НПУ не потребуется производства холостых сбросов. В это время на городском водопроводе будет произведено обследование промоины, разработаны технические решения и проведены необходимые работы по укреплению водопровода.
Согласно прогнозам Гидрометеоцентра РФ, в третьем квартале ожидается среднесуточный приток воды к Зейской ГЭС в объёме 1500-1800 м3/с, прогнозная июльская среднесуточная приточность – 1500-2000 м3/с, фактически в июле в среднем к створу плотины поступает приток воды в объёмах 2400 м3/с.